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<!DOCTYPE html>
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<title>rgee: Acessando a API do Google Earth Engine</title>
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<meta name="author" content="Tainá Rocha" />
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# rgee:<br>Acessando a API do Google Earth Engine
Tainá Rocha
???
This slide uses:
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- a background image
- background-image: url(img/PurpleSky.jpg)
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# Roteiro
- Google Earth Engine (GEE) : Infraestrutura, catálago de dados
- rgee, o fluxo de trabalho
- rgee na prática (R/Rstudio)
???
- Vou falar mostrar o que é/ ou do que se trata Google Earth Engine. Mostrando de forma geral a infraestrutura, o catalágo de dados.
- Depois vou mostrar o pacote rgee. Começando pela instalação que não é algo tão trivial, tem alguns requisitos. Mas também não é algo díficl de outro mundo. Mostraei a sintaxe do pacote.
- Finalizo mostrando estudos de caso
---
.left-column[
# GEE
]
.right-column[
<iframe src="https://earthengine.google.com/" width="100%" height="500" data-external="1"></iframe>
.footnote[https://developers.google.com/earth-engine/datasets/]
]
???
- O GEE é dos serviços oferecidos pelo google. É uma plataforma que além de hospedar dados geoespaciais, oferece uma infraesturtura computacional para análise desses dados.
- Essa é a página inicial do GEE e você encontra várias informações interessantes,sobre como funciona essa infraestrutura.
- E o grande potencial da plataforma, pelo menos até agora é possibilidade de acessar gratutitamente um serviço de alta pefomance, gratuito até certo ponto. Além dessa possibilidade de ter um catálago dados.
- E só pra explicar/ contextulizar melhor sobre essa necessidade de alta perfomance. Isso acontece pela necessidade de termos dados mais refinadso, com mais informação. E Isso acontece em diferentes áreas. Exmplo da figura
- Clicando aqui vocês são direcionados para a página do catálogo de dados, onde você podem acessar os mais diferentes tipos de dados, ou procurar por algum por outros dados. Enfim, é uma das seções que eu mais utilizo.
---
### Volume de dados | Resolução de dados -> Demanda por processamento de alta perfomance
<img src="img/res.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
???
- Pra exemplificar isso essa figura mostra dados to tipo raster, dados matricias. E Basicamente é uma imagem composta por pixeis, onde cade pixel carrega uma informação, nesse caso aqui é informaçõa de temperatura, ou seja eu tenho valores de temperatura para cada pixel. E numa resolução baixa/grosseira os pixeis são maiores, mas estão menor quantidade, ou seja eu vou ter poucos valores para serem analisados ou processados. Já um dados em alta resolução número de pixeis aumenta exponencialmente, e aí a gente passa a ter muito valores para analisar e processar.... o que gera uma demanda por alta perfomance. E daí a importância da plataforma como Engine que te oferece gratuitamente essa infraestrutura.
---
### Infraestrutura do GEE - JavaScript ou Phyton
--
<img src="img/js_py.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" />
--
Code editor : https://code.earthengine.google.com/
<img src="img/cejs.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" />
???
Contudo, a google disponibiliza este serviço em Javascript ou Phyton... Na verdade o editor próprio da plataforma engine e em JS. E isso acaba gerando alguma restrição para quem não tem habilidade com essas linguagens.
---
### Infraestrutura do GEE - JavaScript ou Phyton
<img src="img/R_option.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
--
<iframe src="https://www.theoj.org/joss-papers/joss.02272/10.21105.joss.02272.pdf" width="100%" height="350" data-external="1"></iframe>
???
- E foi assim que esse grupo de pesquisadores de diferentes departamentos criaram a alternativa em R para o acesso ao Google Earth Engine. Para nossa sorte.
- Aqui nesse artigo vocês econtram várias informções sobre o rgee. E o pacote também já está no cran.
---
class: top, center
### Fluxo de Trabalho do rgee
<br>
<br>
<br>
<br>
<img src="img/wf_rgee.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
.footnote[https://r-spatial.github.io/rgee/"]
???
- Esse aqui é fluxo de trabalho do rgee. E resumidamente, o rgee feito em R, conversa muito bem com os principais pacotes R de análises espaciais , que ele chama aqui de ecossistema espacial R. Mas o rgee consegue também conversar com API Python do Earth Engine, graças ao pacote reticulate, que traduz tudo o que é feito no rgee, que na verdade são requisições feitas no rgee que o reticulate traduz para a API python e API por sua vez transforma essa requisição em um JSON que é o formato aceito aqui na plataforma Earth Engine .
---
### Requisitos para o uso do GEE e rgee :
<br>
<br>
--
Conta google (com o Earth Engine ativado)
--
* https://www.google.com/intl/pt-BR/account/about/
* https://earthengine.google.com/
--
Python >= v3.5
--
* [Windows](https://www.python.org/downloads/windows/)
* [Mac](https://www.python.org/downloads/macos/)
--
EarthEngine Python API - Python package*
---
### Referências
- Aybar, C., Wu, Q., Bautista, L., Yali, R., & Barja, A. (2020). rgee: An R package for interacting with Google Earth Engine. Journal of Open Source Software, 5(51), 2272.
- [Documentação](https://cran.r-project.org/web/packages/rgee/vignettes/rgee01.html)
- [Instalações](https://r-spatial.github.io/rgee/articles/rgee01.html#installation)
- [Tutorial](http://www.css.cornell.edu/faculty/dgr2/_static/files/R_html/ex_rgee.html)
- [Repositório](https://github.com/r-spatial/rgee)
- [rgeeExtra](https://r-earthengine.com/rgeeExtra/), extensão para o rgee
- [rgee examples](https://csaybar.github.io/rgee-examples/)
- [Código](https://github.com/Tai-Rocha/RLadies_rgee.github.io/blob/main/R/rgee_exemplos.R), prática/exemplos
???
- Nas referências eu deixei vários conteúdos com informações mais detalhadas.
- E agora eu vou pro R , mostrar um pouco o que dá pra fazer com o rgee.as
---
class: middle, inverse, title-slide
.pull-left[
<br/>
<br/>
<br/>
<br/>
<br/>
<br/>
# Obrigada!
<br/>
]
.pull-right[
### Tainá Rocha
<img style="border-radius: 50%;" src="https://avatars.githubusercontent.com/u/11633554?v=4" width="150px"/>
###
###
[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:1em;width:0.97em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg> @Tai-Rocha](https://github.com/Tai-Rocha)
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[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;width:1em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M326.612 185.391c59.747 59.809 58.927 155.698.36 214.59-.11.12-.24.25-.36.37l-67.2 67.2c-59.27 59.27-155.699 59.262-214.96 0-59.27-59.26-59.27-155.7 0-214.96l37.106-37.106c9.84-9.84 26.786-3.3 27.294 10.606.648 17.722 3.826 35.527 9.69 52.721 1.986 5.822.567 12.262-3.783 16.612l-13.087 13.087c-28.026 28.026-28.905 73.66-1.155 101.96 28.024 28.579 74.086 28.749 102.325.51l67.2-67.19c28.191-28.191 28.073-73.757 0-101.83-3.701-3.694-7.429-6.564-10.341-8.569a16.037 16.037 0 0 1-6.947-12.606c-.396-10.567 3.348-21.456 11.698-29.806l21.054-21.055c5.521-5.521 14.182-6.199 20.584-1.731a152.482 152.482 0 0 1 20.522 17.197zM467.547 44.449c-59.261-59.262-155.69-59.27-214.96 0l-67.2 67.2c-.12.12-.25.25-.36.37-58.566 58.892-59.387 154.781.36 214.59a152.454 152.454 0 0 0 20.521 17.196c6.402 4.468 15.064 3.789 20.584-1.731l21.054-21.055c8.35-8.35 12.094-19.239 11.698-29.806a16.037 16.037 0 0 0-6.947-12.606c-2.912-2.005-6.64-4.875-10.341-8.569-28.073-28.073-28.191-73.639 0-101.83l67.2-67.19c28.239-28.239 74.3-28.069 102.325.51 27.75 28.3 26.872 73.934-1.155 101.96l-13.087 13.087c-4.35 4.35-5.769 10.79-3.783 16.612 5.864 17.194 9.042 34.999 9.69 52.721.509 13.906 17.454 20.446 27.294 10.606l37.106-37.106c59.271-59.259 59.271-155.699.001-214.959z"/></svg> tainaweb-en.netlify.app](https://tainaweb-en.netlify.app/)
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???
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if (!el) return;
var slide, slides = slideshow.getSlides(), els = el[0].children;
for (var i = 1; i < slides.length; i++) {
slide = slides[i];
if (slide.properties.continued === "true" || slide.properties.count === "false") {
els[i - 1].className += ' has-continuation';
}
}
var s = d.createElement("style");
s.type = "text/css"; s.innerHTML = "@media print { .has-continuation { display: none; } }";
d.head.appendChild(s);
})(document);
// delete the temporary CSS (for displaying all slides initially) when the user
// starts to view slides
(function() {
var deleted = false;
slideshow.on('beforeShowSlide', function(slide) {
if (deleted) return;
var sheets = document.styleSheets, node;
for (var i = 0; i < sheets.length; i++) {
node = sheets[i].ownerNode;
if (node.dataset["target"] !== "print-only") continue;
node.parentNode.removeChild(node);
}
deleted = true;
});
})();
// add `data-at-shortcutkeys` attribute to <body> to resolve conflicts with JAWS
// screen reader (see PR #262)
(function(d) {
let res = {};
d.querySelectorAll('.remark-help-content table tr').forEach(tr => {
const t = tr.querySelector('td:nth-child(2)').innerText;
tr.querySelectorAll('td:first-child .key').forEach(key => {
const k = key.innerText;
if (/^[a-z]$/.test(k)) res[k] = t; // must be a single letter (key)
});
});
d.body.setAttribute('data-at-shortcutkeys', JSON.stringify(res));
})(document);
(function() {
"use strict"
// Replace <script> tags in slides area to make them executable
var scripts = document.querySelectorAll(
'.remark-slides-area .remark-slide-container script'
);
if (!scripts.length) return;
for (var i = 0; i < scripts.length; i++) {
var s = document.createElement('script');
var code = document.createTextNode(scripts[i].textContent);
s.appendChild(code);
var scriptAttrs = scripts[i].attributes;
for (var j = 0; j < scriptAttrs.length; j++) {
s.setAttribute(scriptAttrs[j].name, scriptAttrs[j].value);
}
scripts[i].parentElement.replaceChild(s, scripts[i]);
}
})();
(function() {
var links = document.getElementsByTagName('a');
for (var i = 0; i < links.length; i++) {
if (/^(https?:)?\/\//.test(links[i].getAttribute('href'))) {
links[i].target = '_blank';
}
}
})();
// adds .remark-code-has-line-highlighted class to <pre> parent elements
// of code chunks containing highlighted lines with class .remark-code-line-highlighted
(function(d) {
const hlines = d.querySelectorAll('.remark-code-line-highlighted');
const preParents = [];
const findPreParent = function(line, p = 0) {
if (p > 1) return null; // traverse up no further than grandparent
const el = line.parentElement;
return el.tagName === "PRE" ? el : findPreParent(el, ++p);
};
for (let line of hlines) {
let pre = findPreParent(line);
if (pre && !preParents.includes(pre)) preParents.push(pre);
}
preParents.forEach(p => p.classList.add("remark-code-has-line-highlighted"));
})(document);</script>
<script>
slideshow._releaseMath = function(el) {
var i, text, code, codes = el.getElementsByTagName('code');
for (i = 0; i < codes.length;) {
code = codes[i];
if (code.parentNode.tagName !== 'PRE' && code.childElementCount === 0) {
text = code.textContent;
if (/^\\\((.|\s)+\\\)$/.test(text) || /^\\\[(.|\s)+\\\]$/.test(text) ||
/^\$\$(.|\s)+\$\$$/.test(text) ||
/^\\begin\{([^}]+)\}(.|\s)+\\end\{[^}]+\}$/.test(text)) {
code.outerHTML = code.innerHTML; // remove <code></code>
continue;
}
}
i++;
}
};
slideshow._releaseMath(document);
</script>
<!-- dynamically load mathjax for compatibility with self-contained -->
<script>
(function () {
var script = document.createElement('script');
script.type = 'text/javascript';
script.src = 'https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-MML-AM_CHTML';
if (location.protocol !== 'file:' && /^https?:/.test(script.src))
script.src = script.src.replace(/^https?:/, '');
document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(script);
})();
</script>
</body>
</html>