Automatisation de l'extraction de méta-données PubMed avec BioPython

Auteur

Abdelmajid EL HOU - Data Scientist & Ingénieur

Objectif

Ce script Python utilise la bibliothèque BioPython pour extraire des méta-données (PMID, titre et résumé) à partir d'un fichier PubMed au format Medline. Les données extraites sont ensuite enregistrées dans un fichier Excel.

Utilisation

1. Assurez-vous d'avoir installé les bibliothèques nécessaires en exécutant la commande suivante :

   pip install biopython pandas tqdm