Baromètre de la science ouverte de l'UVSQ

Le Baromètre de la science ouverte de l'UVSQ reprend celui de l'université de Lorraine (mars 2020) dont le code a été partagé sur gitlab. Deux modifications ont été apportées : la première permet d'intégrer les publications venant de HAL ne possédant pas de DOI, la seconde apporte des informations sur les frais de publication (Article Processing Charges : APC).

• Présentation des résultats sur uvsq.fr/barometre-science-ouverte

• Télécharger les données ; voir le schéma de données

• Note sur l'intégration des publications de HAL sans DOI

• Note sur la détection des frais de publications

• Reproduire ce baromètre

Intégrer les publications de HAL sans DOI

Afin de minimiser les lacunes, les publications sans DOI venant de HAL ont été intégrées. Cette quantité de publications supplémentaires modifie évidemment les résultats d'accès ouvert, et impacte aussi la méthodogie à plusieurs étapes : dédoublonnage, détection de l'accès ouvert et alignement des rétérentiels.

Résultats

L'intégration des publications de HAL sans DOI baisse le pourcentage de publication en accès ouvert. Voici la comparaison pour l'UVSQ

année	DOI seuls	DOI ou halId
2015	54.8 %	49.3%
2016	56.3%	52.1%
2017	60.2%	56.6%
2018	58.6%	55.1%
2019	58.6%	57.0%

Dédoublonnage

Les publications sans DOI ont été dédoublonnées à partir d'une normalisation des titres : retrait des espaces, accents et mise en minuscule. Les publications de HAL sans DOI ayant un titre identique à une autre publication ont été retirées.

Cette étape permet également d'identifier des publications HAL où le DOI pourrait être manquant (voir les tableaux HAL dans /data/out/).

Détection de l'accès ouvert

Une publication dans HAL est en accès ouvert si au moins une des conditions suivantes est remplie

• la métadonnée submitType_s contient file
• la métadonnée linkExtId_s contient arxiv ou pubmedcentral

Alignement des référentiels

Deux dictionnaires ont été réalisés afin d'aligner (i) les types de document de HAL avec ceux de Crossref et (ii) les domaines scientifiques de HAL avec ceux du baromètre français de la science ouverte. Voir /data/match_referentials.json

Pister les APC

Le but est de savoir si une publication a nécessité des frais de publication (Article Processing Charges : APC). En considérant les "accords transformants" (publish & read), les changements possibles de modèle économique des revues, et enfin les éventuelles exonérations (waivers) il reste difficile de savoir si des APC ont été payés. L'algorithme réalisé propose donc une estimation de la présence ou non d'APC. En décembre 2020 il s'est révélé efficace à plus de 85 %. Enfin, le pistage d'APC se fait au niveau de de l'article, et non des affiliations : l'algorithme reste indifférent à l'établissement ayant payé les APC.

Quatre étapes permettent de détecter la présence d'APC, réalisées par l'algorithme suivant :

• Le DOI est-il dans OpenAPC ?

  • oui, renseigner doi_in_openapc et extraire le montant payé

  • non, la revue est-elle dans OpenAPC et des frais de publications ont-ils été payés la même année ?

    • oui, renseigner journal_in_openapc et extraire la moyenne des montants payés sur l'année

    • non, le document est-il en open access sur le site de l'éditeur dans une revue hybride ? (utilisation du champs oa_status de unpaywall)

      • oui, renseigner journal_is_hybrid
      • non, la revue est-elle une revue avec APC indéxée dans le DOAJ ?
        • oui, retourner apc_journals_in_doaj, le prix et la devise

Reproduire ce baromètre

0. Installer Python et les libraries signalées dans le fichier requirement.txt
1. Télécharger l'archive au format .zip
2. Ajouter les fichiers bibliographiques de votre établissement
3. Renommer si nécessaire les noms des fichiers importés dans le code a_consolider_sources.py
4. Exécuter les codes a_consolider_sources.py puis b_enrichir_data.py, ce dernier doit tourner pendant plusieurs heures afin de récupérer les données de HAL et Unpaywall (env. 4h pour 16k publications). Enfin exécuter c_produire_graphique.py
5. Retrouver les graphiques générés dans le dossier img

Schéma de données

column	description (if needed)	source
doi
halId	Publication deposit id in HAL	hal
hal_coverage	Hal coverage (in or missing )	hal
title		hal or unpaywall
genre	Document type	hal or unpaywall
author_count	Curiosity : number of authors	hal or unpaywall
published_date		hal or unpaywall
published_year		hal or unpaywall
journal_name		hal or unpaywall
journal_issns		hal or unpaywall
publisher		hal or unpaywall
upw_coverage	Unpaywall coverage (oa, missing, closed)	unpaywall
oa_status	Status/type of open access (green, gold, hybrid, bronze)	unpaywall
upw_location	Where OA is founded (repository and/or publisher)	unpaywall
version	Publication version available (submitted, accepted, published)	unpaywall
licence	licence finded in unpaywall	unpaywall
journal_is_in_doaj	Is this resource published in a DOAJ-indexed journal	unpaywall
journal_is_oa	Is this resource published in a completely OA journal	unpaywall
is_paratext	Is the item an ancillary part of a journal (column disappear if everything is False )	unpaywall
suspicious_journal	Is the journal in "predatory" list	Stop Predatory Journals
hal_submittedDate	When the publication has been submitted in HAL	hal
hal_location	Where OA is founded (file, arxiv, pubmedcentral), notice if not OA	hal
hal_licence	Licence in HAL deposit	hal
hal_serlArchiving	Curiosity : is the deposit made by the author	hal
hal_docType	Type of document	hal
hal_domain	Domain, scientific field	hal
apc_tracking	APC information (doi_in_openapc, journal_in_openapc, journal_is_hybrid, apc_journals_in_doaj)	openapc, doaj, unpaywall
apc_amount	Rough approximation of APC cost	openapc, doaj
apc_currency		openapc, doaj
scientific_field	Scientific field from barometre-science-ouverte and hal	barometre-so, hal
is_oa	Is there an OA copy of this ressource	hal, unpaywall
oa_type	Publisher and/or repository	hal, unpaywall

Voir aussi

• le baromètre français de la science ouverte https://ministeresuprecherche.github.io/bso/
• le baromètre de l'université de Lorraine http://scienceouverte.univ-lorraine.fr/barometre-lorrain-de-la-science-ouverte/

Remerciements

Eric Jeangirard et Laetitia Bracco. Les équipes et communautés derrière Unpaywall, DOAJ et OpenAPC.