Правила make-файла:
make result — скомпилировать, вывести результат в файл output;
make result-r — скомпилировать, вывести результат в файл output и на экран;
make clean — почистить директорию.
Настройки программы в файле input.
P.S. Это один из первых репозиториев (если не самый первый), поэтому о содержательности коммитов не может быть и речи.